前几期小编已经向大家分享了好多RNA提取小技能：
今天，小编将会对RNA提取中一些特殊案例进行介绍，希望能对大家平常的工作、学习、实验有所帮助~
特殊案例一：
物种：小鼠
组织：胸椎段脊髓
服务类型：circRNA测序
初步等级评定：D（共有四级，A为最佳，B、C其次，D最差）
最终样本质量评估：可继续下游实验
理由：
（1）图①②出现的特殊峰型不属于样本降解范畴，而是出现了“28S rRNA 断裂”现象。
（2）虽total RNA出现“28S rRNA 断裂”，但18S rRNA和其它类型的RNA仍然保持完整，根据我司特有的文库构建方案，该现象对于后续的文库构建以及数据质量不会造成任何影响。
特殊案例二：
物种：凡纳滨对虾
组织：眼柄、腮
服务类型：miRNA测序/转录组测序
初步评估：C
最终评估：可进行下游实验
理由：
（1）凡纳滨对虾属于甲壳类动物，甲壳类样本的RNA质检图的典型特征就是单峰。
（2）从两幅图中均可以出，主峰比较锐利，峰型比较单一，都没有出现逐级弥散，峰型分布比较有规律，均呈现出非典型特征峰，不属于降解范畴。
（3）两幅图都是凡纳滨对虾，只不过图①是眼柄，RNA呈紫色，而图②是腮，RNA为正常颜色，理论上同一物种的不同器官应呈现出相同的峰型，但是图①却表现出了自己独有的峰型，并且峰型分布呈现规律性，这是因为色素干扰了bioanalyzer对样本的正常读取。
特殊案例三：
物种：human
组织：cell（临床样本）
服务类型：miRNA/circRNA测序
样本评估：A
最终评估：可进行下游实验
问题：
① 和②在数据分析过程中发现支原体污染严重，且①的污染程度比②更严重，但是观察①和②的质检图，可以发现：①很难看出有支原体污染，因为18S峰前和28S峰前几乎看不出有16S和23S的峰，②还是可以看出有一点16S和23S峰的痕迹。真核生物有原核污染的话，在建库方面不易去除，在数据分析这块原核污染的数据能不能过滤掉污染数据具体还要看数据量是否够，否则该数据只能放弃。
特殊案例四：
物种：胡杨
组织：叶
服务类型：circRNA/miRNA测序
初步评估：C
最终评估：可进行下游实验
理由：
（1）虽然①和②的Rin值处于临界值（6-7），但①和②的主峰比较锐利，峰型比较单一，无拖带，条带之间弥散不明显。
（2）①和②的都是做的circRNA/miRNA测序，即使RNA的18S和28S出现轻微降解，其它类型的RNA仍可见完整性较好，根据咱们特有的建库方案，这类临界值样本并不会影响下游实验的进行。
特殊案例五：
物种：Human
组织：全血
服务类型：miRNA测序
初步评估：C
最终评估：编号为“O”的样本可进行下游实验
问题：
编号为“O”的质检图与人全血的标准质检图相比，峰型图存在特殊的地方，18S和28S前后均出现了杂碎的小峰，不能确定这些小碎峰是否为28S断裂堆积而成，也不能确定的说这些小碎峰是否为28S的降解片段，也不能确定这些小碎峰是否是由于仪器不稳定造成的，很难判断，但可以肯定的是所有的峰看起来都是比较整齐的，没有显得杂乱无章，而且主峰比较锐利，模拟电泳图中无拖带，所以该类样本可以考虑做miRNA，LncRNA，cicrRNA，保险起见不建议做mRNA相关实验。
特殊案例六：
物种：仿刺参
组织：呼吸树
服务类型：miRNA测序
最终评估：A
最终评估： 可进行下游实验
问题：
“3c-5-RT”为仿刺参的呼吸树与刺参呼吸树的标准质检图相比，“3c-5-RT”的质检图中的 28S峰后出现了一个明显的峰，该峰比较锐利，无明显拖带，这说明该峰并不是有杂质污染，一般28S峰后紧跟的峰属于前体RNA，通常代谢旺盛的部位，前体RNA丰度会比较高，说明这两个样本的代谢比较旺盛，故前体RNA比较丰富。
