两种变异鉴定方式,让细菌基因组变异无处可藏!-产品资讯-资讯-生物在线

两种变异鉴定方式,让细菌基因组变异无处可藏!

作者:联川生物技术公司 2016-05-18T09:57 (访问量:5066)


文末有亮点!一定要看完哦!

细菌基因组重测序是对基因组序列已知的细菌个体进行基因组测序,通过与已知的参考基因组比对,获得该细菌个体或群体的差异的测序方法。

这些差异主要包括SNP、InDel、和SV(如下图)。目前微生物基因组重测序被广泛应用于病原微生物的检测及鉴定、病原菌演变及起源、致病菌种群结构及种群结构的进化等众多方面。


图1 SNP示意图

图2 Insertion示意图


图3 Deletion示意图


图4 SV示意图

两种变异鉴定策略,让细菌基因组变异无处可藏

我们提供两种比对参考基因组的策略,一种是基于Read比对另一种是基于Read组装的序列(Contig)比对。你可以任意指定一种适合实验设计和样本特性的比对方式,进行基因组变异鉴定和注释。基于我们的经验,基于组装序列的比对方式,对于SV的检测会更具优势。分析流程如下图。


图5 联川细菌基因组重测序分析策略

从宏观到微观,广泛的微生物组研究解决方案

无论你是做微生物群落多样性分析,还是做宏基因组功能解析,还是研究单个细菌的基因组或是基因组上的变异,我们都有成熟的解决方案,任你选!

  • 微生物群落多样性分析(16S rDNA测序/ITS测序)

  • 宏基因组功能解析(宏基因组测序)

  • 细菌基因组测定(细菌完成图测序)

  • 细菌基因组变异鉴定(细菌基因组重测序)

细菌基因组重测序限时特惠

2016.5.18至2016.6.30日,前100个细菌基因组重测序样本,【特惠价1999元/样本】此优惠不与其他活动同享。赶紧约起!

回复“案例”,查看联川合作课题组近期发表的研究工作


本周(5.16~5.20),我们将到访古都西安,继续春季全国巡讲的行程。

西安的小伙伴,快来现场与我们互动,现场有惊喜哦!

回复“巡讲”,查看联川2016春季巡讲主题与日程。


联川生物技术公司 商家主页

地 址: 杭州经济技术开发区下沙6号大街260号中自科技园16幢4层

联系人: 吴先生

电 话: 0571-87662413

传 真: 0571-81951905

Email:market@lc-bio.com

相关咨询

快来围观,你离高分paper还差一个phasiRNA (2019-01-14T13:34 浏览数:4522)

如何选择合适的qRT-PCR内参基因? (2019-01-14T11:06 浏览数:18297)

为什么要做绝对定量测序-数据分析 (2018-09-21T17:59 浏览数:4313)

低通量单碱基m6A验证的新方法|m6A专题 (2018-09-18T16:04 浏览数:4308)

祝贺联川客户继Nature后又发一篇Nature Genetics (2018-09-18T16:03 浏览数:4124)

联川生物八月份客户文章汇总 (2018-09-18T16:02 浏览数:3005)

联川生物七月份客户文章汇总 (2018-09-18T16:01 浏览数:2972)

肝硬化与肝纤维化研究进展 (2018-09-18T16:01 浏览数:10797)

【用户案例】感染鲫鲤疱疹病毒2的银鲫中miRNA的差异表达 (2018-09-18T16:00 浏览数:3029)

病毒m6A专题 | HIV感染宿主促进病毒及T细胞m6A修饰 (2018-09-18T16:00 浏览数:3581)

ADVERTISEMENT