萝卜是一种重要的根菜类蔬菜作物，其肉质直根为可食用部分。重金属胁迫对萝卜的种植和生产有重大影响。越来越多的证据显示，microRNA（miRNA）介导的基因调控在重金属胁迫应答中起着重要作用。不过，目前几乎没有信息是关于在铅毒性应答时植物miRNA的表达模式或调控作用的。南京农业大学柳李旺教授带领的研究团队从分子水平上对萝卜在铅（Pb）胁迫下的调控网络和反应机制进行了研究*，研究成果发表在7月刊的Plant Molecular Biology Reporter上。
研究人员通过高通量测序和降解组分析（降解组测序项目由联川生物承担完成），对Pb胁迫下的萝卜进行了全基因组水平的miRNA鉴定并探讨了miRNA调控的靶基因。实验从两个萝卜根文库中（一个是未经处理的萝卜根，另一个是Pb胁迫的萝卜根）共鉴定出74个已知的和173个潜在的新miRNAs。其中，25个已知的和9个新发现的miRNAs有显著差异表达，并鉴定为Pb应答miRNAs。降解组分析显示，1979对miRNA-mRNA靶向转录本很有可能被剪切。GO分析表明，这些靶向转录本主要参与转录调控，防御反应和结合相关的功能。Pb应答miRNAs调控的靶基因主要参与胁迫相关信号的感知和传导，特定金属的吸收，以及体内平衡机制。另外，研究人员通过实时荧光定量PCR（qRT-PCR）技术，对20个Pb应答miRNAs和6个靶基因的表达模式进行了验证。
此研究结果表明，miRNA在Pb胁迫时，发生显著地差异表达，在Pb应答过程中起到调控作用。研究结果也为植物应答Pb胁迫时miRNA介导的调控网络和分子机制提供了基本见解。
*Yan Wang, Wei Liu, Hong Shen, et al.Identification of Radish (Raphanus sativus L.) miRNAs and Their Target Genes to Explore miRNA-Mediated Regulatory Networks in Lead (Pb) Stress Responses by High-Throughput Sequencing and Degradome Analysis (2014) Plant Molecular Biology Reporter. doi: 10.1007/s11105-014-0752-y [article]
获取更多用户研究案例，请访问www.lc-bio.com或拨打免费咨询热线800-857-1452。
关于联川生物
联川生物总部位于美国休斯敦（LC Sciences, LLC），经过多年的快速发展，已成为业界**的多组学技术服务商。公司拥有具有自主知识产权的µParaflo®微流体定制化芯片平台，可以为科研用户提供从基因组，转录组，到蛋白组的高通量定制化表达谱芯片解决方案。我们是全球首家提供microRNA表达谱芯片分析的服务商。作为国内最早提供高通量测序技术服务的公司之一，联川生物拥有经验丰富的技术团队和一流的生物信息学专家组，可以为研究人员提供多组学测序服务和深度个性化数据分析解决方案。为满足研究人员跨组学高通量研究需求，联川生物已将蛋白质组定量分析引入技术服务线，为用户提供贯穿中心法则的全程解决方案。多年来，联川生物一直与国内的科研团队保持着长期紧密的合作，助力科研人员在生物、医学、和农林领域的科学发现。全球科研用户使用联川生物的优质科研服务和高质量组学实验数据已发表了逾600篇高水平研究论文，其中已在Cell，Nature，Science系列顶级期刊上发表论文十七篇。