C端测序（C-terminal sequencing）是一种专门用于解析蛋白质C端序列的技术，在蛋白质组学研究中具有价值。与传统的N端测序相比，该技术因其技术难度较大，发展相对较晚。但近年来，质谱（Mass Spectrometry, MS）技术的快速发展，使得基于MS的C端测序在蛋白质结构和功能的研究中越发重要。

一、方法

基于MS的C端测序主要依赖于高分辨率质谱仪的精确检测能力，结合特定的化学或酶解策略，以实现对C端序列的解析。常见的方法包括：

1、特异性酶解策略

由于蛋白质的C端往往缺乏稳定的序列特征，利用特异性蛋白酶进行选择性剪切是实现C端序列分析的关键。例如，某些羧肽酶（Carboxypeptidase）可以从C端逐步释放氨基酸，并结合MS进行检测，从而获得C端序列信息。这种方法的优势在于特异性强，但在遇到复杂结构或修饰时可能受限。

2、化学衍生化方法

另一种策略是通过化学修饰来增强C端的检测信号。例如，利用C端特异性衍生化试剂可以封闭C端，使其在后续的MS分析中更易被识别。此类方法可提高检测灵敏度，同时减少肽段二级碎裂的不确定性。

3、串联质谱（MS/MS）技术

现代MS/MS技术，如高分辨质谱（HRMS）、电子转移解离（ETD）、高能碰撞解离（HCD）等，为C端测序提供了强有力的工具。这些方法能够生成更丰富的碎片离子信息，使C端氨基酸序列的解析更加精准。

4、全蛋白级别的C端测序

随着顶端降解技术（Top-down proteomics）的发展，研究者可以直接在完整蛋白水平上分析C端序列，而无需进行酶解。这种方法避免了蛋白酶的特异性限制，在解析具有翻译后修饰（PTMs）的蛋白质C端时尤其有优势。

二、应用

1、蛋白质结构与功能解析

C端序列直接影响蛋白质的折叠、稳定性及相互作用。通过精准测定C端序列，可帮助研究者理解蛋白质的结构-功能关系，推动生物学研究的发展。

2、蛋白翻译后修饰（PTMs）研究

C端常常是蛋白修饰的区域，例如泛素化、磷酸化和糖基化等。基于MS的C端测序能够识别这些修饰并分析其生物学意义，为信号通路研究提供数据。

3、抗体及生物制药质量控制

在单克隆抗体和重组蛋白药物开发过程中，确保蛋白质的C端序列完整性至关重要。基于MS的C端序列分析可用于蛋白质表征和质量控制，以检测是否存在异常剪切或修饰。

4、蛋白质降解机制研究

许多蛋白的降解途径与C端信号有关。例如，某些蛋白的C端序列决定了其在细胞中的半衰期。利用MS技术解析C端序列，可帮助研究者揭示蛋白降解的分子机制，为疾病研究提供新的视角。

基于MS的C端测序在近年来取得了显著进展，但还有一些例如C端信号的低丰度、序列复杂性及翻译后修饰的干扰等限制。未来的研究方向包括开发更高效的酶解策略、优化化学衍生化方法，以及结合人工智能算法提升MS数据解析能力。此外，单细胞蛋白质组学和超高分辨MS技术的发展，也将为其带来新的机遇。百泰派克生物科技提供专业的蛋白质N/C端测序服务，可解决您的项目问题，加速您的研究项目，为您带来优质的服务体验。

百泰派克生物科技特色项目

一、蛋白测序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪及岛津公司埃德曼降解测序系统对蛋白质序列进行分析，提供基于质谱的蛋白测序分析服务，包括对蛋白质的氨基酸组成分析，N端测序，C端测序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的蛋白质N端序列分析服务。对于未知理论序列的蛋白质，提供基于从头测序法的蛋白质从头测序服务，对蛋白序列进行分析。

※服务优势：

1.采用目前世界上先进的质谱仪器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可实现对所测定靶蛋白序列 100% 的覆盖;

3.可测定蛋白N端多达 70个氨基酸序列;

4.可测定多种形式的样品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白条带;

5.样品用量低: 蛋白样品仅需 5-10ug，即可完成检测;

6.测序不受N端封闭，PEC和和糖基化等N端修饰的影响。

二、蛋白质组学

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC，提供定量蛋白质组学、靶向蛋白质组学、多肽组学、翻译后修饰蛋白组学等多种蛋白质组学分析服务。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白质组学服务，助力微量样本蛋白组学、大样本群医学及高通量修饰组学等研究工作。

※服务优势：

1 .高通量定量蛋白分析:多对照组大规模实验分析，发现新的生物标记物;

2.体内体外多种蛋白质标记方法，适用于分析组织、细胞、血液等多种样品;

3.质谱分析灵敏度高，实验结果重复度高;

4.可检测较低丰度蛋白，线性范围广;

5.专业生物信息学分析，分析更系统准确。

三、单细胞质谱流式技术分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm质谱流式系统进行单细胞质谱流式技术分析，采用金属元素标记物（通常是金属元素标记的特异抗体）标记细胞表面和内部的分子，然后用流式细胞原理分离单个细胞，再用电感耦合等离子体质谱（ICP-MS）分析单个细胞的原子质量谱，最后将原子质量谱数据转换为细胞表面和内部的信号分子表达量。

※服务优势：

1.技术先进，填补技术空白

采用金属标记抗体技术，避免了传统流式荧光通道少且易相互影响的问题。可在单细胞层面上对多种指标同时进行表征，百泰派克生物科技可做到同时检测51个目标蛋白。

2.分析数量大，成本较低

单细胞RNAseq受成本等因素限制，所有样本细胞汇总的分析数目一般在2x10^4个左右，而流式质谱技术一次（单样本）就可分析至少10^5的细胞，实现了数量级的提高，且成本不高于单细胞RNAseq。

3.应用前景大

①流式质谱结果可以给出细胞亚群的变化，在临床诊断、疾病机制研究等方面具有极大的研究前景；

②将金属标签技术与其他技术结合会有新应用方向。除常规蛋白外，质谱流式细胞技术还可用于蛋白翻译后修饰；

③可检测细胞存活率、细胞大小、mRNA转录子表达量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现

百泰派克生物科技的基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现一站式解决方案包括我们专有的、高度敏感的免疫肽富集和鉴定方案。我们能够帮助您实现10,000个以上I型多肽和10,000个以上II型多肽的鉴定和识别。通过我们优化的高通量免疫多肽组学分析平台进行免疫肽组学分析，可从最小的样品材料中进行可重复的识别和定量。该服务可以应用于大规模的研究，旨在助力科研工作者寻找癌症、免疫疾病及传染病的解决方案，深入挖掘未知的靶标。

五、生物药物表征

百泰派克基于高分辨率质谱技术，MALDI TOF，高效色谱分离技术，提供一系列完善的生物药物分析方案，从蛋白质、多肽、抗体、疫苗等生物制品的氨基酸组成和一级结构分析，到产品变异性和纯度分析。旨在提供优质生物药物分析服务，帮助生物医药生产商提高生物药物品质。

百泰派克生物科技七大检测平台

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物质谱多组学优质服务商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于为生物/制药和医疗器械行业提供质量控制检测和项目验证等专业服务。公司实验室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法规和指导原则，通过CNAS/ISO9001双重质量体系认证，建立了完备的质量体系，数据冷热/异地备份，设备定期计量/期间核查，软件审计追踪，为客户提供一体化解决方案和技术服务，支持新药研发、药物申报注册和生产放行。

1.公司采用ISO9001质量控制体系，专业提供以质谱为基础的CRO检测分析服务；

2.获国家CNAS实验室认可，为客户提供符合全球药政法规的药物质量研究服务；

3.业务范围覆盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等；

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