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华大科技small RNA测序全新升级

作者:华大科技 2014-07-09T10:32 (访问量:2728)

 

华大科技small RNA测序全新升级

产品简介
Small RNA是一类重要的体内调节分子,主要包括miRNA、piRNA和siRNA。它的功能主要是诱导基因沉默,参与基因转录后调控,从而调节细胞生长、分化以及个体发育、生殖等重要生物学过程。Small RNA测序技术采用胶分离技术,收集样品中18~30nt的RN**段,利用高通量测序技术,一次性获得单碱基分辨率的数百万条small RNA序列信息,依托强大的生物信息分析平台,鉴定已知miRNA,并预测新的miRNA及其靶标基因。

产品升级内容
所用软件更多样,获取结果更准确提供多款可选靶基因和miRNA预测软件,满足不同客户需求的同时进一步提高结果可靠性和准确性
分析内容更全面,数据挖掘更深入增加更多权威数据库用于small RNA分类注释;增加组间样品差异分析;增加生物学重复分析
结果展示更清晰,查阅读取更便利结果图片更加直观,结题报告结构优化,有效提升阅读体验

 

部分结果展示

动物miRNA靶基因预测

图1 动物miRNA靶基因预测
采用4种软件targetscan、PITA、RNAhybrid和miRanda预测的miRNA::相应靶基因的交集

组间样品差异分析

图2 组间样品差异分析
横坐标表示要比较的差异组,纵坐标表示miRNA在两样品组中的表达量

GO term树形结构图

图3 GO term树形结构图
展示富集度最高的前10个GO term。下层GO term是上层GO的子term;椭圆形和方框代表一个GO term(包含富集程度值),其中方框代表该分支最底层的GO term。不同颜色表示不同的富集程度,颜色越红,富集度越高

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